唐菖蒲全株由根、茎、叶、花、果等部分组成。

根有初生根与支撑根两种类型。初生根在种球基部的节位发生，是一种不定根，粗细均匀，基本上不生侧根。这种根通常在球茎播种后先叶而发，是植株生长前期的主要吸收根。支撑根是在新球形成后，在新球茎部节位发生，具有对植株的支撑固定功能。这种根比初生根粗壮，肉质，直径为3～4mm，长度可达50～80cm，是唐菖蒲孕蕾、开花与新球发育期的主要吸收根。

茎有球茎、葡匐茎、花茎3个类型。球茎是一个短缩的变态茎，大约有7个环状茎节组成，其上分布有5～6个芽眼，由于大量贮存养分，肥大成为圆球形或扁球形，其周径长10～14cm，球茎外表包裹一层褐色皮膜。球茎是营养贮藏器官，也是主要繁殖器官。当年用于切花生产的球茎称为种球．种球在生长后期，随着新生植株的生长发育逐渐萎缩消亡。而在种球顶芽萌发形成新株的基部，短缩茎又肥大发育形成新球。在新球与种球之间，即新球基部的1～3个节位上，在开花前后可发生匍匐枝。匍匐枝水平生长，能分枝。在各分枝顶端的顶芽肥大生成子球，子球是唐菖蒲扩繁与解决种球退化的重要繁殖器官。花茎是从新球叶丛中抽出，由顶芽发育而成。

叶有鞘叶、基生叶与茎生叶3种类型。鞘叶是唐菖蒲生长前期的一种不完全叶，只有叶鞘部分而无叶片。鞘叶着生于芽的四周，共6～10枚，以鳞片状覆盖子幼芽上，起保护生长点的作用。最外围的第一、第二片鞘叶呈革质干鳞片状，在芽萌发时脱落。第三至第六片鞘叶，可随芽的发育而生长。通常第三、四片鞘叶不露出土面，第五、六片保护幼芽顶出土面。鞘叶出土后，通常又有5～7枚完全叶丛生于种球顶部，这几片叶称为基生叶，长约40cm，宽5～6em，带状，先端尖，星剑形，鲜绿色，叶基部折叠，呈二列状抱茎互生，基生叶的叶鞘抱合组成假茎，这些叶是唐菖蒲进行光合作用的主要营养叶。基生叶发育良好，对切花的花芽分化与产花质量有很大影响。茎生叶是后生于花茎上的2～4片同化叶，一般均比基生叶小。

花为顶生蝎尾状聚伞花序，通常每花序可着花8～20朵，最多可达24枚。部分品种花序有1～2个小分枝，切花的商品生产要求每个花序至少有小花12朵以上。花序上的小花自下而上逐朵开放。花被6枚，分内外两层。外花被3枚，内花被3枚。雄蕊3枚，雌蕊1枚，柱头3裂，子房下位，3室。花瓣有平瓣、波状、皱瓣等变化。花瓣外包被2枚苞片，卵状披针形，大小不等，绿色革质。花色的色彩丰富齐全，有许多复色品种。切花生产的小花型

品种花径多数在6.5～9cm左右。大花型品种花径多数为11.5～14cm。

蒴果，种子在授粉后约35～45d成熟，每果含种子15～70粒，千粒重为5.2～7.5g。一般除杂交育种外，均不留种。